המודל הטיפולי והמערכתי של פנימיית ביתנו נשען על הרעיון שלקהילה חלק תרפויטי מרכזי בשיקום הנער ושילובו בקהילה. בשל העובדה שחניכים בוגרי פנימיות במדינת ישראל, חוזרים לחיי קהילה לאחר גיל 18, אנו מאמינים שאת תהליך השיקום והחזרה לקהילה צריך להתחיל מרגע שיבוצו בפנימייה ועל מנת לחזק את תחושת השייכות והמסוגלות של החניכים. בין הפנימייה לקהילה מתקיימים יחסי גומלין בהם שני הצדדים יוצאים נשכרים.